Magyarország 1945-ben felszabadult a német megszállás alól, az orosz parochiák a Moszkvai Patriarchátus fennhatósága alá kerültek. 1949. november 11-én a Szent Zsinat határozatával „az eddig senki fennhatósága alá nem tartozó, vagy a háború alatt orosz fennhatóságot vesztett magyar ortodox egyházközségeket a Magyar Ortodox Egyházközségek Ideiglenes Igazgatóságává egyesíti”, melynek vezetőjeként Kopolovics Jánost rendelik adminisztrátor címmel. Többek között ekkor csatlakozik ehhez az új egységhez a nyíregyházi Szent György nagyvértanú egyházközség is. A rendelkezés megjegyezte, hogy a Moszkvai Patriarchátus csak azokat az egyházközségeket fogadja joghatósága alá, amelyek ezt kérik, nem tartoznak más joghatóság főpásztori hatósága alá, és kívül esnek a kánoni gondozáson; Az ortodox magyarok „jogot kaptak arra, hogy minden szolgálatot és szolgáltatást magyar nyelven végezzenek”.
A Magyar Ortodox Adminisztratúra püspökei
1949. november 11. – 1960. június 21.
főtisztelendő Nyikolaj (Jarusevics) Krutick és Kolomna metropolitája
1960. július 10. – 1972. május 30.
főtisztelendő Nikodim (Rotov) Podolszki püspök
1960. november 23-tól Jaroszlavli és Rosztovi püspök
1961. június 10-től érsek
1963. augusztus 3-tól metropolita
1963. augusztus 4-től Minszk és Fehéroroszország metropolitája
1963. október 9-től Leningrád és Ladoga metropolitája
1967. október 7-től Leningrád és Novgorod metropolitája
1972. május 30. – 1981. április 14.
főtisztelendő Juvenalij (Pojarkov) Tula és Belevszk metropolitája
1977. június 11-től Krutick és Kolomna metropolitája
1981. április 14. – 1989. november 13.
főtisztelendő Filaret (Vahromejev) Minszk és Fehéroroszország metropolitája
1989. november 14. – 1996. március 21.
főtisztelendő Kirill (Gundjajev) Szmolenszki és Kalinyingrádi érsek
1991. február 25-től metropolita
Jelenleg Moszkva és egész Rusz patriarchája
1996. március 21. –1999. december 29.
főtisztelendő Feofan (Galinszkij) Berlin és Németország érseke
1999. december 29. –2000. április 19.
főtisztelendő Pavel (Ponomarev) Bécsi és Ausztriai püspök
2000. április 19-én a Moszkvai Patriarchátus Szent Szinódusának rendelkezésével a Magyar Ortodox Adminisztratúra parochiái önálló egyházmegyévé alakultak.
A Magyar Ortodox Egyházmegye püspökei
2000. április 19. – 2003. május 7.
főtisztelendő Pavel (Ponomarev) Bécsi és Budapesti püspök
2001. február 23-tól érsek
2003. május 7. – 2009. március 31.
főtisztelendő Hilarion (Alfejev) Bécs és Ausztria püspöke, ideiglenes kormányzó
2009. március 31. – 2015. október 22.
főtisztelendő Mark (Golovkov) Jegorjevszki püspök, ideiglenes kormányzó
2010. február 1-től érsek
2015. október 22. – 2017. december 28.
főtisztelendő Tyihon (Zajcev) Podolszki püspök, ideiglenes kormányzó
2017. december 28. – 2019. május 30.
főtisztelendő Anthonyij (Szevrjuk) Bécsi és Budapesti püspök
2018. február 1-től érsek
2019. május 30. – augusztus 30.
főtisztelendő Joann (Roscsin) Bécsi és Budapesti metropolita
2019. augusztus 30. – 2022. június 7.
főtisztelendő Mark (Golovkov) Budapest és Magyarország metropolitája
egyúttal Rjazanyi és Mihajlovszki metropolita
2022. június 7-től
főtisztelendő Hilarion (Alfejev) Budapest és Magyarország metropolitája
A nyíregyházi Szent György nagyvértanú egyházközség papjai
1944. – 1972. január 2. (+)
Galetzky Szergij protoierej, adminisztrátor helyettes
1970-es évek vége
(Piko) Mózes szerzetespap
1985. – 1998. február 26. (+)
Úsz István pap
1998. – 2006.
(Szabó) Efrém szerzetespap
2006. –
Krank József pap
2016-tól miskolci parochusi kinevezést kapott
2023. június 10. –
Szegedi Szabolcs István pap